プロジェクトに対応するcproject.yml を開きます。

groupsの下に、次のような新しいグループを追加します。

- group: NewGroup
  files:
   - file: ./mySourceFile.c

または、-fileエントリを使用して既存のグループにファイルを追加します。ファイルの追加方法については、公式の CMSIS-Toolboxドキュメントを参照してください。